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甘肃省医药学校现设有药剂、药物分析、药品营销、中药学、医药电子商务、生物制药技术和医药卫生财会等7个专业。其中药剂专业是我校的优势专业，医药电子商务、生物制药技术和医药卫生财会是我校的特色专业。所有专业的学制都是三年(高中班两年)，学生在校学习近两年(高中班一年)，主要学习基础课程和专业课程，进行必要的专业技能训练。学生掌握了就业必需的专业知识和技能以后，由学校招生就业办公室推荐到工作岗位进行顶岗实习和就业，实习期间享受企业工资待遇。
甘肃省医药学校环境
甘肃省医药学校教学设施完备。设有计算机室、多媒体教室、药用植物标本室、生药标本室、中药鉴定实验室、中西药调剂室以及教学药店等实验实训设施，为开展实践教学提供了有力的保障。尤其是建立了学校虚拟仿真制药厂，利用计算机仿真技术对制药企业的制剂全过程及设备操作过程进行仿真模拟，为学生在走向工作岗位之前提供一个非常贴近实际情景的锻炼环境。药用植物标本室收藏有全省药源普查的全部标本资料，属全省唯一，是教学和科研的珍贵资源。
甘肃省医药学校兼职教师30人，其中高级讲师10人，讲师13人，助理讲师7人。还常年从兰大、中医学院固定外聘教师8人，形成了一支内外聘结合以内聘为主，专兼职结合以专职为主的经验丰富的高素质师资队伍。学校还与沈阳药科大学合作设立了沈阳药科大学甘肃函授站进行函授专科和本科学历教育，以药学专业为主，学制两年半。学生在校学习期间可通过成人高考参加函授专科学习，进行进一步深造，提高学历。另外，学生也可参加“三校生”考试到其他高等院校对口专业进行学习。
